We Are Scientists foi formado em 2000, em Berkeley, Califórnia, mas em 2001 se mudou para Nova York tendo o vocalista e guitarrista Keith Murray, o baixista Chris Cain e o baterista Michael Tapper na sua formação. Apesar de se estabelecer em Nova York, mais precisamente no Brooklyn, o trio pode confundir os menos avisados, que podem achar que se trata de mais uma banda britânica, já que a sua música está bem próxima do som praticado por grupos contemporâneos como Franz Ferdinand, Bloc Party e outros que se destacaram nos anos 2000, oriundos do Reino Unido. A banda americana, assim como a escocesa Franz Ferdinand e a inglesa Bloc Party, e tantas outras surgidas no começo do milênio, bebe na fonte do pós-punk, que muitos anos depois ainda serviu para revigorar o rock.
A banda lançou três EPs antes da Virgin Records colocar no mercado, em janeiro de 2006, o seu álbum de estreia, With Love and Squalor. Em 2007, o baterista Michael Tapper deixou a banda, e, no ano seguinte, o grupo lançou o seu segundo álbum, Brain Thrust Mastery, como um duo, Keith Murray e Chris Cain. Em 2009, o ex-baterista do Razorlight, Andy Burrows, se juntou ao We Are Scientists. O terceiro álbum, Barbara, chegou em 2010. TV en Français foi lançado em 2014. A banda retornou com um novo álbum em 2016, quando lançou Helter Seltzer.
We Are Scientists ampliou sua discografia com Megaplex (2018), Huffy (2021) e Lobes (2023).
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